Protein ZmC3H26 | |
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Information | |
TF Name: | ZmC3H26 |
Species: | Maize |
TF Family: | C3H |
Gene Name(Synonym): | C3H26 |
Uniprot ID: | B4FAX8 |
Subgenome: | 2 |
ZmC3H26 is a protein in the C3H family.
Overview of domains present in v5 transcripts | |||||
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PF00013 | PF00642 | PF16131 | PF18044 | PF18345 | |
Zm00001eb275730_T002 | |||||
Zm00001eb275730_T001 |
Gene ID | Type | MEME Logo | Sequence | FIMO | Position |
---|---|---|---|---|---|
Zm00001d036796 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d036796 | DAPseq | sequence | fimo | position | |
Zm00001d036796 | ChIPseq | sequence | fimo | position | |
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Secondary Structure Color Code | |
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BEND | region with high backbone curvature without specific hydrogen bonding |
HELX_LH_PP_P | left-handed polyproline helix |
HELX_RH_3T_P | right-handed 3-10 helix |
HELX_RH_AL_P | right-handed alpha helix |
HELX_RH_PI_P | right-handed pi helix |
STRN | beta strand |
TURN_TY1_P | type I turn |
UNDETERMINED | no data available |
Domains Present | |
---|---|
PF16131 |
|
PF00642 |
|
PF18044 |
|
PF18345 |
|
PF00642 |
|
PF18044 |
|
PF16131 |
|
PF18345 |
|
PF00013 |
|
PF00013 |
|
PF16131 |
|
PF00642 |
|
PF18044 |
|
PF18345 |
|
Hover here to show all domains |
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ATCAGTTGCGGCCGCGCGCTCGTGCCGTTGCGCTGCGGCAAAGCCTCCCCCCACACCTCTCTCCTCCACCCGCCGCCCCCGCGGGACCGAAACCCTAGCTAGGGTTCTGCCCGCCGCCGCCGCCGCCTTCGATCCAGACGCGGCCAGGCTTCCCGCAACACCGCCATGGACACGGGCCGCAAGCGGACCGCACCGGAGGGCGCCAACGGCGCGGGCGGCCCCAAGCGCGCGAGAGAATCGGAGACAACTGGTGTAGGAAGCAAATCCAAGCCGTGCACCAAATTTTTCAGCACTGCGGGTTGCCCCTTTGGTGCAAGTTGCCATTTTCTCCATAACTTCCCGGGTGGCTACCAGGCCGTTTCAAAGATGACCAACTTGGGTGGACCGCCTGTTCCGGCTCCACCAGGAAGAATGCCTATGGGACCTGGTGGTCCTGATGGGCCACCTTCACCTGCTGTGAAGACTCGCATGTGTAACAAGTACAACACTGCCGAAGGATGTAAATGGGGGAGCAAGTGCCACTTTGCTCATGGAGAGAGGGAGCTTGGAAAGCCCCTGCAGATGGACAACCCGATGGGACCTCCTCCAATGGGGCCAGGGCCCAACGGGCACTTCATGCCACCGCCAATGCCTTTCCCAGACATGGTTCCTCCCTCCACATTCGGTGCTTCCGCCACAGCCAAGATCAGCGTCGATGCATCCCTTGCTGGTGCCATCATTGGGAAGGGTGGTACCAACACAAAGCATATATCCCGAGTGACTGGGGCCAAGTTAGCCATCCGGGACAACGAGGCTGATCCCAACCATAAAAACATCGAGCTCGAGGGAACATTTGACCAGATCAAGCACGCTAGCGCAATGGTCACAGAGTTGATTGTCCGCATCAGTGGTAAGCCGCCTCCACAAGCCAAGAACAACCCAGGTAGGGGGCCTGGTTCTCATGCCGGGGGTCCTGGAAGCAACTTCAAAACCAAATTGTGCGAGAACTTCAACAAAGGCTCCTGCACCTTTGGAGACAGGTGCCACTTCGCCCATGGCGAAGGTGAGCTGCGCAAACCTGCTGCTGCTTGACAGGCATGCTTATTGTGGCCTGTGGTGATTAATCTGCCTGTATGGCTGAATAACACCATGACCAAGGACAGTGGCGCCAGCGCCATGGTGAAGTGTGCTGAGCCACATGCTGCCTGAGAGAGAGCATTTCCCTGTGGCTCGTATTTGATCTTAATGCTGTAACAAACTCTCCTCGATGGAGATTAAGCAATGGCCGTTTATTTAGGATTTGTAGGATTGCCGTATTGGTCACCCTTTTATCTATCCTGTTTTTGGCCTGTGGTGATTAATCTGCCTGTATGGCTGAATAACACCATGACCAAGGACAGTGGCGCCAGCGCCATGGTGAAGTGTGCTGAGCCACATGCTGCCTGAGAGAGAGCATTTCCCTGTGGCTCGTATTTGATCTTAATGCTGTAACAAACTCTCCTCGATGGAGATTAAGCAATGGCCGTTTATTTAGGATTTGTAGGATTGCCGTATTGGTCACCCTTTTATCTATCCTGTTTTTGTACCGTTTCTTAGGCACTCTTGGCTGGCAGATCATTGTGAGTCTGTTGAACTTGAGAATAGTTGCTATTGATGTTATCGGTTTGTGGATTCTTACTA
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